migale
Contrôle qualité des données de séquençage Illumina
2022/02/15
L’objectif de ce tutoriel est d’analyser la qualité de données de séquençage Illumina avec seqkit, FastQC et MultiQC. […] Évaluer la qualité des données issues d’un séquençage haut-débit est la …
L’infrastructure de Migale
2022/06/30
Ce post a pour objectif de vous présenter et de vous apprendre à utiliser l’infrastructure mise à disposition par la plateforme Migale : modalités d’accès (création de compte, connexion aux …
Metabarcoding analaysis (16S rRNA marker) with FROGS
2023/01/20
The purpose of this post is to show you how to analyze 16S metabarcoding datasets (Illumina 16S V3-V4 region) from the command line with FROGS on the migale server and how to explore data in a BIOM …
16S Metagenomics Training - Chaillou dataset analysis
2019/03/01
This vignette is a re-analysis of the data set from Chaillou et al. (2015), as suggested in the Homeworks section of the slides. Note that this is only one of many analyses that could be done on the …
16S Metagenomics Training - Ravel dataset analysis
2019/03/01
This vignette is a re-analysis of the data set from Ravel et al. (2011), as suggested in the Homeworks section of the slides. Note that this is only one of many analyses that could be done on the …